実践ケモインフォマティクス

〜主にケモインフォマティクス, 個人的備忘録, 理論より実践重視〜

まとめ

Tips(プログラミング関連)

matplotlib を日本語表示対応させる japanize matplotlibをインストール pip install japanize-matplotlib japanize_matplotlibをmatplotlibと共にインポートする import matplotlib.pyplot as plt import japanize_matplotlib pickle の活用 データや学習済…

Tips(解析関係)

(20'/12/13 更新) クロスバリデーションの分割数 1000 サンプル以上 : 2-fold クロスバリデーション 1000 から 100 くらいまで : 5-fold クロスバリデーション 100 から 30 くらいまで : 10-fold クロスバリデーション 30 以下 : leave-one-out クロスバリ…

外部データベースのまとめ(ケモインフォマティクス )

主にケモインフォマティクスで活用できそうな外部データベースのまとめ。 API利用などで一括取得が可能 Pubchem 化合物のデータベース。(APIを使った自動取得が可能) (参考:pubchem から化合物情報を一気に取得する) ChemSpider 化合物のデータベース。(AP…

〇〇インフォマティクス勉強のためのおすすめHPメモ

はじめに マテリアルインフォマティクスを進めるための情報収集・勉強のためのHPのまとめ (2020/11/7 更新) ケモインフォマティクス関連 明治大学金子研究室HP 一般的なデータ解析の流れ、予測モデルの紹介から、データ解析での化合物の取り扱い、解析のノ…