実践ケモインフォマティクス

〜主にケモインフォマティクス, 個人的備忘録, 理論より実践重視〜

データベース

pubchem から化合物情報を一気に取得する

目的 化合物の基本的な情報(化合物名やCASなど)から、その化合物の情報(カノニカルSMILESや、分子量などの基本的な記述子)を取得する。 (SMILES情報があれば記述子を計算→化合物の物性予測の変数として使用できるが、SMILESを収集するのが面倒なので自…

外部データベースのまとめ(ケモインフォマティクス )

主にケモインフォマティクスで活用できそうな外部データベースのまとめ。 API利用などで一括取得が可能 Pubchem 化合物のデータベース。(APIを使った自動取得が可能) (参考:pubchem から化合物情報を一気に取得する) ChemSpider 化合物のデータベース。(AP…