実践ケモインフォマティクス

〜主にケモインフォマティクス, 個人的備忘録, 理論より実践重視〜

外部データベースのまとめ(ケモインフォマティクス )



主にケモインフォマティクスで活用できそうな外部データベースのまとめ。

API利用などで一括取得が可能

(おそらく)一括取得が不可

  • Polyinfo 高分子の物性に関するデータベース。利用するには登録が必要。スクレイピングなどのデータの一括取得は基本的には禁止されている。

  • Bordwell pKa Table pKa のデータベース。構造化データではないため解析に使用するにはデータの整形が必要。

調べる

  • CAS アメリカ化学会が運営しているデータベース

  • PubChemQC 量子化学計算のデータベース

  • ZINC15 バーチャルスクリーニング用途に市販化合物を集めたデータベース

  • ChEMBL 化学構造と生物活性データを集めた、医薬品・医薬品候補化合物データベース

  • PDB タンパク質の立体構造データベース

  • CCDC 低分子や結晶構造のデータベース
  • SDBS 有機化合物のスペクトルデータベース

参考

以下のHPの情報を使わせてもらいました。